Если вы работаете в режиме * iehta, то тут и там вы столкнетесь с некоторыми глюками. Мы запускаем Selenium на моей работе, и, похоже, у меня много проблем с IE и AJAX.
Тем не менее, похоже, что проблема, с которой вы сталкиваетесь, заключается в том, что Selenium пытается получить доступ к компоненту в другом окне, прежде чем он полностью загрузится. Я не уверен, какой диапазон времени ожидания по умолчанию установлен, но вы можете попробовать увеличить его до 60 (60000 мс) секунд или около того, чтобы обойти проблему.
Кроме того, я бы предложил запустить ваши тесты в Firefox (используя * chrome), поскольку он дает гораздо более надежные результаты, но иногда это просто невозможно из-за требований бизнеса.