Конечно, вы можете использовать CruiseControl с VB6. Вам просто нужно иметь файл сборки ANT, который строит ваш проект VB6. Цель, включающая что-то вроде следующего, измененное для ваших конкретных имен файлов и каталогов, должна работать, предполагая, что vb6.exe находится на пути.
<exec dir="ApplicationDir" executable="vb6.exe" failonerror="true">
<arg line="ProjectFile.vbp /MAKE /OUT build.log"/>
</exec>