Сначала создайте и проверьте папку с именем trunk, переместите все ваши файлы и папки в папку trunk с помощью svn move.Если у вас есть TortoiseSVN, вы можете перемещаться с помощью обозревателя хранилища.
Затем создайте папку с именем branches и папку с именем tags, и вы вернетесь в нужное русло со стандартной компоновкой.В транке, тегах и ветвях нет ничего особенного, это просто соглашение об именах.