В моей системе библиотека JSTL 1.1 содержит файлы jar:
jstl.jar
standard.jar
Относительно того, где они находятся, они похоронены в Netbeans.
В частности, (на моей машине Mac) в моей домашней папке есть папка .netbeans.
Уверен, что это существует и в Windows.
В .netbeans есть папка для вашей конкретной версии (в данном случае 6.5).
Внутри этого находится каталог модулей.
Банки расположены по адресу:
.netbeans/6.5/modules/ext/jstl.jar
.netbeans/6.5/modules/ext/standard.jar
Ассоциация банок с библиотекой производится в файле:
.netbeans/6.5/modules/org-netbeans-modules-web-jstl11.jar
Если все эти файлы не повреждены, попробуйте удалить папку:
.netbeans/6.5/var/cache
NetBeans создает это, и если NetBeans начинает глупо обращаться с вами, стирая его и перестраивая его, он может очистить вас.