Предполагая, что на большинстве серверов Linux установлены FTP-серверы или включена поддержка SSH, вы можете установить FTP-клиент на рабочий стол Windows, FTP / SFTP на сервер Linux и передавать что-либо вверх / вниз таким образом.
Вот сообщение , подробно описывающее, как - если вы хотите поэкспериментировать с использованием командной строки и psftp.