Просто чтобы добавить к этой теме, я обнаружил, что по какой-то странной причине на сервер публиковались только файлы Mercurial, а все остальное просто не копировалось.
Другая странная вещь заключалась в том, что была доступна только конфигурация Debug ; Релиз нигде не было видно.
Прочитав другие темы вокруг S.O., я обнаружил, что их было много для VS 2010 и 2012, но не так много, чтобы покрыть ту же проблему с 2008.
Исправление, которое я обнаружил, состояло в том, чтобы удалить файл [решение] . suo и затем выполнить попытку публикации. Это, казалось, делало работу, хотя для ее завершения требовалось много времени.