Я только что прошел ту же проблему. Вы должны переустановить Aptana, перейти в «Настройки» -> «Aptana Studio» (или что-то еще) -> «Темы» и выбрать Aptana Studio 2.x, которая использует белый фон и черный передний план.
Эта панель настроек исчезнет, как только вы, к сожалению, удалите ее. Что-то глупо для них, чтобы изменить в этом плагине, но я думаю, что быть резким важнее, чем быть последовательным:)