Невозможно передать несколько приложений с текущей интеграцией AppHarbor <> GitHub.
Это хорошая идея, и я недавно отправил GitHub запрос на получение , поэтому очень скоро можно будет указать список приложений. Я опубликую обновление, когда оно будет объединено.
Теперь можно указывать разделенный запятыми список слагов приложений, например: foo,bar,baz
при настройке службы AppHarbor на GitHub. Это подтолкнет ваш код ко всем перечисленным приложениям.