Я совершенно уверен, что в принципе невозможно, чтобы PHP-скрипт на виртуальном хостинге выполнял функции настоящего POP3 / SMTP-прокси.
Запросы, поступающие от клиентов, будут использовать эти протоколы и попытаться подключиться к вашему серверу Godaddy. У этого сервера будет либо собственный POP3 / SMTP-сервер, который прослушивает эти порты, либо его нет.
Для этого вам понадобится сервер, на котором у вас есть полные права суперпользователя - но тогда вам больше не понадобится PHP, там будут более удобные инструменты для этого.