Обычно код использует встроенный в Matlab генератор случайных чисел.Вы можете заполнить его следующим:
rng = RandStream.getDefaultStream;
rng.reset(your_seed_value_here);
Можно также создавать RandStream
объекты и использовать их (таким образом избегая потока по умолчанию), но это должно работать большую часть времени.