В общем, вы должны удалить бит в шаблоне темы, который выполняет навигацию, которая управляется этим кодом:
$OUTPUT->standard_top_of_body_html();
Тем не менее, правильный способ подключиться к этому - использовать механизм верстки движка темы. См. Документацию для макетов страниц здесь .
Например, если вы установите макет страницы на «всплывающее», он удалит все остальное, кроме содержимого.
$PAGE->set_pagelayout('popup');