Нет никакого способа сделать это в сумо, так что это действительно зависит от вашей платформы / личных предпочтений. В Linux самый простой способ - это, вероятно, сценарий оболочки, лучше всего использовать кросс-платформенный сценарий Python (при условии, что у вас есть Python):
import subprocess
for i in range(100):
subprocess.call(["sumo", "-c", "my.sumocfg", "--random", "--output-prefix", str(i)])