Как я могу импортировать несколько файлов fasta из нескольких подпапок в список списков - PullRequest
0 голосов
/ 17 июня 2019

У меня есть несколько подпапок ("C1", "C2", "C3"), и каждая из этих подпапок содержит четыре файла fasta.
Я хотел бы импортировать это так, чтобы каждая подпапка была элементом спискаи каждый элемент должен содержать четыре отдельных элемента, по одному для каждого файла fasta в соответствующей подпапке.

До сих пор я только импортировал несколько файлов fasta непосредственно в список, используя:

library(Biostrings)
temp = list.files(pattern="*.fasta")
myfiles = lapply(temp, readDNAStringSet)

Но я не знаю, как читать их из нескольких подпапок и использовать эти подпапки какэлемент вышестоящего списка.
Надеюсь, понятно, о чем я.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...