Если вы пытаетесь построить на удаленном сервере, пересылку ssh X11 можно использовать для отображения графиков matplotlib.
Попробуйте использовать это,
import matplotlib
matplotlib.use('tkagg')
Убедитесь, что у вас XMing или XQuartz (если вы используете Mac), и используйте -Y
$ shh -Y username @ servidorIP