Почему мое регулярное выражение не работает, чтобы удалить раздел заголовка fastta

Question

Я хочу удалить все между ">" и "Un_" в заголовке, таком как

>NW_017859640.1 Esox lucius isolate CL-BC-CA-002 unplaced genomic scaffold, Eluc_V3 Un_scaffold1210

Я пробовал несколько итераций регулярных выражений. Ничто, содержащее "*", кажется, не работает

sed 's/^NC_*Eluc_V3 //' 

и используя этот шаблон

sed 's/NC_*Eluc_V3 //'

В конце концов, я бы хотел

>Un_scaffold1210

Answer 1

Попробуйте с помощью:

sed 's/^>.*Un_/>Un_/'

Здесь я ищу > в начале строки, сопровождаемый вещами и заканчивающийся Un_, и заменяя эту строку просто >Un_.

Кажется, легче искать то, что вы сказали нам, которые являются вашими маркерами, чем пытаться угадать, что должно быть внутри этих маркеров, как вы пытаетесь это сделать.