Просто установите соответствующие элементы в вашей ковариационной матрице на 0
:
library(MASS)
set.seed(1)
(sig <- matrix(c(5, .5, .8, .5, 1, 0, .8, 0, .5), 3))
# [,1] [,2] [,3]
# [1,] 5.0 0.5 0.8
# [2,] 0.5 1.0 0.0 ## <- 0 = covariance between s2 and s3
# [3,] 0.8 0.0 0.5
x <- mvrnorm(1e5, rep(0, 3), sig)
cov(x)
# [,1] [,2] [,3]
# [1,] 5.0356870 0.5100643820 0.8004814044
# [2,] 0.5100644 1.0042540190 0.0008037978
# [3,] 0.8004814 0.0008037978 0.4972328657
## with empirical = TRUE you can force the cov matrix to match exactly sig
cov(mvrnorm(1e5, rep(0, 3), sig, empirical = TRUE))
# [,1] [,2] [,3]
# [1,] 5.0 5.000000e-01 8.000000e-01
# [2,] 0.5 1.000000e+00 -2.267044e-15
# [3,] 0.8 -2.267044e-15 5.000000e-01
Обновление на основе комментариев
Если проблема заключается внайти положительно определенную матрицу корреляции, вы можете использовать Matrix::nearPD
, чтобы найти ближайшую положительно определенную матрицу:
set.seed(1)
sig <- structure(c(0.000225, 0.0002625, 0.00044625,
0.0002625 , 0.000625, 0,
0.00044625, 0 , 0.001225),
.Dim = c(3L, 3L))
cov(mvrnorm(1e5, rep(0, 3), Matrix::nearPD(sig, TRUE, TREU)$mat, empirical = TRUE))
# V1 V2 V3
# V1 1.00000000 2.625000e-04 4.462500e-04
# V2 0.00026250 1.000000e+00 3.614917e-15
# V3 0.00044625 3.614917e-15 1.000000e+00