Масштаб карты Pheatmap отличается от масштаба до карты Pheatmap. - PullRequest
Новая
       29

Масштаб карты Pheatmap отличается от масштаба до карты Pheatmap.

0 голосов
/ 04 июня 2019

Тепловая карта при масштабировании до 

mat_scaled<-scale(t(mat))
pheatmap(t(mat_scaled),show_rownames = F,show_colnames = F,border_color=F,color = colorRampPalette(brewer.pal(6,name="PuOr"))(12))

масштабирование тепловой карты перед построением графика с масштабом, идущим от [-2, 6], полностью отличается от того, когда мы запускаем масштабирование в функции pheatmap 

pheatmap(t(mat_scaled),scale = "row",show_rownames = F,show_colnames = F,border_color=F,color = colorRampPalette(brewer.pal(6,name="PuOr"))(12))

тепловая карта, масштабированная в функции pheatmap где масштаб установлен от [-6,6]. Почему эта разница и как я могу получить матрицу, представленную на втором рисунке?

...