Как создать базу данных SQLite из 30 файлов fasta в R? - PullRequest
0 голосов
/ 13 мая 2019

Я хочу провести выравнивание гомологичных областей 30 множественных геномов с пакетом "DECIPHER" R. У меня есть 30 последовательностей в формате fasta, но функция пакета требует базы данных sqlite с геномами.

Я пытался использовать функцию RSQLite dbWriteTable и те, которые появляются в пакете "sqldf", но они, похоже, допускают только файлы csv.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...