Ошибка с Python-скриптом, названным Phaster

Question

Я установил PHASTER , клонировав каталог Github в мою папку HOME.Однако после ввода команды

phaster.py --contigs --fasta path/to/genome.fasta

я получил эту ошибку, которая гласила:

2019-07-11 14: 32: 02,389 ИНФОРМАЦИЯ: Отправка TH19.fna представляется успешной

2019-07-11 14: 32: 02,390 ИНФОРМАЦИЯ: job_id: ZZ_0f276b0c53

2019-07-11 14: 32: 02,390 ИНФОРМАЦИЯ: ошибка: заголовок последовательности находится не в первой строке.Пожалуйста, проверьте!

Трассировка (последний последний вызов):

Файл "/home/fox/phaster_scripts/phaster.py", строка 162, в

job_id, status, date = submit_job(fasta, options.url, {"contigs": int(options.contigs)})

Файл "/home/fox/phaster_scripts/phaster.py", строка 99, в submit_job, возвращает r_dict ["job_id"], r_dict ["status"], datetime.datetime.now ()

KeyError: 'status '

Кто-нибудь знает, как решить эту проблему?

Answer 1

Это известная проблема с phaster-скриптами отметьте это