Я пытаюсь запустить модель распределения элементарных видов, а biomod2 не отображает данные о моем присутствии. Я могу попытаться воссоздать проблему здесь, но, очевидно, я не могу загрузить файл TIF, с которым я работаю. Чтобы проверить это, я просто создал матрицу значений долготы и широты, соответствующих прямой вертикальной линии в Колумбии, следующим образом:
tmp <- seq(-1,10,0.01) # latitude
tmp2 <- rep(-75,length(tmp)) # longitude
testVec <- cbind(tmp2,tmp)
myRespXY <- testVec
Это координаты данных моего присутствия. Затем я только использую данные о присутствии, поэтому у меня есть
myResp <- as.numeric(rep(1,nrow(myRespXY)))
Затем, используя функцию форматирования для biomod2,
myBiomodData <- BIOMOD_FormatingData(resp.var = myResp, # presence data (all 1's)
expl.var = myExpl, # RasterStack
resp.xy = myRespXY, # coordinates of presences, corresponding to a vertical line in Colombia
resp.name = myRespName) # name of species
plot(myBiomodData)
Смотрите вывод здесь.
Что я делаю не так? biomod2 читает присутствия, и иногда он отображает несколько точек, но большинство из них он не отображает. Как я могу получить выходные данные для построения всех данных присутствия?