Как исправить размер изображения NIFTI, чтобы соответствовать? - PullRequest
Новая
       46

Как исправить размер изображения NIFTI, чтобы соответствовать?

1 голос
/ 18 мая 2019

Я не могу загрузить изображение сегментации с основным изображением. Я получил сегментированное изображение после обработки (выходной тест), где размеры основного изображения и сегментированного не совпадают, но я хочу объединить основное изображение с сегментированным изображением любымрешение, пожалуйста, чтобы сопоставить сегментированное изображение с основным изображением?

я попытался сопоставить отображаемое сообщение: «размер изображения сегментации не совпадает с основным изображением, изображения должны иметь одинаковые размеры» ввести изображениеописание здесь

1 Ответ

1 голос
/ 21 мая 2019

Вам может понадобиться изменить размер изображения до того же размера, что и исходное изображение - при условии, что ваша сегментация имеет то же происхождение, что и входное изображение, эта функция должна сделать это. 

import SimpleITK as sitk

def resample_image(input_img, input_seg,  is_label=False):
    dimension = 3

    original_spacing = itk_image.GetSpacing()
    original_size = itk_image.GetSize()

    resample = sitk.ResampleImageFilter()
    resample.SetOutputSpacing(original_spacing)
    resample.SetSize(out_size)
    resample.SetOutputDirection(input_img.GetDirection())
    resample.SetOutputOrigin(input_img.GetOrigin())
    resample.SetTransform(sitk.Transform(dimension, sitk.sitkIdentity))
    resample.SetDefaultPixelValue(input_img.GetPixelIDValue())

    if is_label:
        resample.SetInterpolator(sitk.sitkNearestNeighbor)
    else:
        resample.SetInterpolator(sitk.sitkBSpline)

    return resample.Execute(itk_image)
...