Это то, что для меня слово, цикл по каждой таблице в конце
foreach (Table item in doc.Tables)
{
item.Rows[1].HeadingFormat = -1;
item.ApplyStyleHeadingRows = true;
}
и установка стиля для каждой таблицы со свойством, установленным для создания заголовка для каждого нового
t.set_Style(TableStyle);