Прочитать ввод hdf5 порциями в библиотеке rhdf5 - PullRequest
0 голосов
/ 28 октября 2018

Я хочу прочитать в матрице из файла hdf5 и напрямую преобразовать его в dgcMatrix, поскольку он слишком велик для RAM.Есть ли способ сделать это в R?Вот что я хочу сделать:

dge <- as(h5read(path_to_file, 'rawcounts'), "dgCMatrix")

В настоящее время я получаю сообщение об ошибке из-за нехватки памяти.

...