Я пытаюсь найти базу данных строк для определенного шаблона.Я хочу искать образец в прямом и...

У меня есть файл Genbank размером ~ 3 ГБ, содержащий полные аннотации Genbank для ~ 20000...

Я создаю базу данных, в которой будут храниться данные последовательности ДНК, которые представляют...

У меня есть список (около 100000) строк ДНК, каждая из которых имеет длину 21. Я хочу найти общие...

Я начну анализ RNAseq, на самом деле у меня есть конвейер, но я хочу изучить альтернативные...

У меня много проблем с вычислением правильных значений Fst для моих SNP.Хотя в моих данных нет...

Я пытаюсь демультиплексировать чтения ДНК, которые были подготовлены с использованием нового...

Я вывел все начальные и конечные позиции в пределах строки ДНК, и теперь я хотел бы отобразить...

У меня есть следующий вектор v:...

пример входного файла: 1 AAcgGGGGGGtacctgt yes 2 TTcccccctgtAAcgta no 3 tcgAAAAaatacgacc no 4...

У меня есть данные последовательности ДНК. Например, X="ACGGGT" Y="ACGGT" Я...

У меня есть хеш с именем %id2seq, который содержит последовательности последовательностей ДНК, на...

Моя общая цель этого кода - найти мотив (меньшую последовательность) в каждой последовательности...

Я хотел бы применить одномерную свертку к последовательности ДНК фиксированного размера с...

Чтобы вручную изменить имеющийся у меня файл .gff, мне нужно найти начальную позицию моего гена в...

Я пытаюсь написать программу, которая перемещается по элементам определенной длины...

Я хочу подсчитать количество оснований в последовательности ДНК, вернуть счетчики каждого типа...

Я пытаюсь создать сеть гаплотипов, используя пегас.Мне удалось создать базовую сеть, но когда я...

Я пытаюсь удалить строки в файле, которые начинаются с тех же 5 символов, однако первые 5 символов...

Я только начал изучать программирование на python. В классе нас попросили сгенерировать случайную...

У меня есть последовательность гена -...

У меня есть пример последовательности ДНК, такой как: S = ATGCGGGCGTGCTGCTGGGCTGCT.... длиной 5 МБ

Я пытаюсь загрузить файл fasta из NCBI по следующему конвейерному протоколу на основе Perl: esearch...

import random def pair(): base = random.choice('AGCT') if base == 'A': base =...

Я пытаюсь найти совпадение определенной длины (от 4 до 12) в последовательности ДНК Ниже приведен...