Чтобы вручную изменить имеющийся у меня файл .gff, мне нужно найти начальную позицию моего гена в отформатированном FASTA геноме моего животного (т. Е. Какая # база находится в последовательности?). У меня есть последовательность этого гена.
Как мне сделать это как можно проще (это не животное, чей геном легко доступен в Интернете)?
Что у меня есть: геном, в формате FASTA; файл GFF, содержащий аннотацию для генома этого организма (который должен быть очень обновлен); последовательность этого гена.
Спасибо!