Мне нужно извлечь от 5 до 11 символов из моих данных fastq.gz, эти данные слишком велики для...
Я работаю с Bash на кластере Linux.Я пытаюсь извлечь чтения из файла .fastq, если они содержат...
Я пытаюсь объединить файл fasta и файл qual в новый файл fastq, имея в виду случай, когда два файла...
Я пытаюсь перебрать текстовый файл g-zip.Формат таков, что данные находятся в блоках по четыре...
Я работаю на машине с Linux, используя Bash. Мой вопрос, как я могу пропустить строки в файле...
У меня есть имена файлов, подобные следующим: fastqs/hgmm_100_S1_L001_R1_001.fastq.gz...
Для простоты использования и совместимости с другим нисходящим конвейером я пытаюсь изменить имена...
У меня есть этот код, который читает из файла и записывает в другой файл, но файл записи пуст....
Я пытаюсь заставить регулярное выражение работать с rename; Я попробовал подход с аналогичными...
У меня проблема с некоторыми чтениями fastq: @1V3F_10526394...
Я недавно скачал кучу файлов sra.и мне нравится конвертировать их в парные чтения fastq.Это...
Я сравниваю кучу файлов fastq.gz.Каждый файл ~ 4G: if filecmp.cmp(f1,f2,shallow=False) Возвращает...
Вот немного моего кода: for((a=1;a<=8000000;a++)) do if (($a%4==0)) then b=`cat 101127_2_aa_1
Я должен проверить наличие миллионов элементов (20-30 букв стр.) В списке, содержащем 10-100 тыс....
Мне нужно составить список большого количества файлов (40000 файлов), как показано ниже:...
у меня два пути path1 = "/home/x/nearline" path2 = "/home/x/sge_jobs_output" В...
У меня есть данные, которые всегда поступают в блоке из четырех в следующем формате (называемом...