Вопросы с тегом fastq - PullRequest

Вопросы с тегом fastq

0 голосов
3 ответов

Мне нужно извлечь от 5 до 11 символов из моих данных fastq.gz, эти данные слишком велики для...

Codezy / 14 декабря 2018
0 голосов
3 ответов

Я работаю с Bash на кластере Linux.Я пытаюсь извлечь чтения из файла .fastq, если они содержат...

Paul / 13 декабря 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь объединить файл fasta и файл qual в новый файл fastq, имея в виду случай, когда два файла...

Anso / 09 декабря 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь перебрать текстовый файл g-zip.Формат таков, что данные находятся в блоках по четыре...

barspurk / 28 ноября 2018
0 голосов
1 ответ

Я работаю на машине с Linux, используя Bash. Мой вопрос, как я могу пропустить строки в файле...

Paul / 24 ноября 2018
0 голосов
2 ответов

У меня есть имена файлов, подобные следующим: fastqs/hgmm_100_S1_L001_R1_001.fastq.gz...

Jack Arnestad / 21 октября 2018
0 голосов
1 ответ

Для простоты использования и совместимости с другим нисходящим конвейером я пытаюсь изменить имена...

Gunther / 10 октября 2018
0 голосов
0 ответов

У меня есть этот код, который читает из файла и записывает в другой файл, но файл записи пуст....

Sofia / 07 сентября 2018
0 голосов
2 ответов

Я пытаюсь заставить регулярное выражение работать с rename; Я попробовал подход с аналогичными...

Leonardo Normando / 26 июня 2018
0 голосов
1 ответ

У меня проблема с некоторыми чтениями fastq: @1V3F_10526394...

Giffredo / 24 мая 2018
0 голосов
1 ответ

Я недавно скачал кучу файлов sra.и мне нравится конвертировать их в парные чтения fastq.Это...

user3042163 / 23 мая 2018
0 голосов
1 ответ

Я сравниваю кучу файлов fastq.gz.Каждый файл ~ 4G: if filecmp.cmp(f1,f2,shallow=False) Возвращает...

FairyDuster / 26 апреля 2018
0 голосов
3 ответов

Вот немного моего кода: for((a=1;a<=8000000;a++)) do if (($a%4==0)) then b=`cat 101127_2_aa_1

LookIntoEast / 28 ноября 2011
19 голосов
4 ответов

Я должен проверить наличие миллионов элементов (20-30 букв стр.) В списке, содержащем 10-100 тыс....

Leszek / 18 августа 2011
8 голосов
3 ответов

Мне нужно составить список большого количества файлов (40000 файлов), как показано ниже:...

LookIntoEast / 11 августа 2011
0 голосов
2 ответов

у меня два пути path1 = "/home/x/nearline" path2 = "/home/x/sge_jobs_output" В...

LookIntoEast / 27 июня 2011
17 голосов
13 ответов

У меня есть данные, которые всегда поступают в блоке из четырех в следующем формате (называемом...

neversaint / 09 октября 2009
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...