Я пытаюсь использовать функцию fastq-dump из пакета SRA Toolkit https://trace.ncbi.nlm.nih

Я хочу отфильтровать мои последовательности, содержащие более 8 одинаковых последовательных...

У меня вопрос, как написать скрипт, чтобы: 1. Рассчитать значение ascii в очень большом файле fastq

Я хотел бы извлечь только те операции чтения, которые имеют покрытие более 2 и длину более 504. Все...

Я запускаю fastQC на компьютере с Linux из командной строки. До v.0.11.5 я также использовал для...

Я пытаюсь прочитать файлы fastq, используя следующую функцию: library("ShortRead")...

Я пытаюсь отредактировать файл fastq, который представляет собой просто текстовый файл для хранения...

Я пытаюсь извлечь определенную последовательность из файла fastq, используя grep для поиска...

Я пытаюсь подсчитать длину каждого чтения в файле fastq из секвенирования illumina и вывести его в...

У меня есть файл данных последовательности в формате fastq https://en.wikipedia

Мне нужно загрузить набор файлов последовательностей, хранящихся в подкаталогах 1000 геномов,...

У меня есть два файла fastq, которые я хочу сравнить.Структура файлов fastq следующая ( на чтение...

Извините за плохое название, я не знаю, как еще сформулировать мой вопрос. Я написал скрипт,...

Я пытаюсь работать с файлами Fastq, и у меня произошла следующая ошибка: File...

Я пытался найти ответ на свой вопрос, просматривая похожие темы, но безуспешно. Может быть, я...

У меня проблемы с использованием awk NR==FNR для возврата интересующих строк из входного файла