Обработка данных FASTQ из базового пространства, иллюминатора для генерации матрицы подсчета - PullRequest
0 голосов
/ 08 апреля 2020

Я только начал изучать R и хочу проанализировать свои данные Rna-seq.

У меня есть файлы fastq, хранящиеся в baseapce. Но эти файлы довольно большие (> 200 ГБ) и делятся на разные файлы.

Как обработать эти данные и сгенерировать матрицу подсчета, которую можно использовать для R-анализа?

Спасибо!

...