строка 358, в процессе TypeError: неупорядоченные типы: list ()> int () error - PullRequest
Новая
       56

строка 358, в процессе TypeError: неупорядоченные типы: list ()> int () error

0 голосов
/ 24 апреля 2020

Я выполняю quickq-dump на рабочей машине с использованием библиотеки python os: 

cmd_vdg = "{}/vdb-config --prefetch-to-cwd".format(sra_toolkit_folder)
ret_val_cmd_vdg = os.system(cmd_vdg)
cmd_fasterq = "{}/fasterq-dump {} -O {} -f".format(sra_toolkit_folder,srr,local_fld)
ret_val_cmd_fasterq = os.system(cmd_fasterq)

Значение выполнения cmd_fasterq: /opt/userowned/sratoolkit.2.10.5-centos_linux64/bin/ fastq-dump SRR4784332 -O / SRR4784332 / READS -f

Эта ошибка, которая запускается: строка 358, в процессе TypeError: неупорядоченные типы: list ()> int ()

Any совет в чем может быть проблема.

Большое спасибо, eilalan

...