Не могу использовать fastq-dump из SRA Toolkit, потому что не могу найти XML / LibXML.pm в @INC - PullRequest
0 голосов
/ 05 ноября 2019

Я пытаюсь использовать функцию fastq-dump из пакета SRA Toolkit https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=toolkit_doc&f=st Я получил ошибку

Не могу найти XML / LibXML.pm в @INC (вам может потребоваться установить модуль XML :: LibXML) (@INC содержит: /Users/darinaobukhova/anaconda3/lib/site_perl/5.26.2/darwin-thread-multi-2level / Users / Дарьяобухова / anaconda3 / lib / site_perl /5.26.2 /Users/darinaobukhova/anaconda3/lib/5.26.2/darwin-thread-multi-2level /Users/darinaobukhova/anaconda3/lib/5.26.2.) В строке ./fastq-dump 13. НАЧАТЬ не удалось -компиляция прервана в строке ./fastq-dump 13.

Я установил модуль XML :: LibXML, используя

cpan install XML :: LibXML

Однако я продолжаю получать ту же ошибку.

Кто-нибудь может помочь?

...