Я уже задавал этот вопрос в разделе биоинформатики, но я вижу, что здесь есть еще несколько связанных с цирком запросов, поэтому я хотел бы снова опубликовать свой вопрос здесь вопрос
Есть пакеты R, которые я не пробовал, так как с моей стороны немного проще было создать формат данных и запустить их, но я не получаю сюжет, как я хотел бы, учитывая, что он генерируется, но выглядит довольно глупо вроде трудно сделать вывод.
Итак, у меня есть один набор файлов, который содержит ген и местоположение их хромосом, а другой набор файлов - местоположение хромосом всех генов вместе с мутацией пациента.
- DC3_DC7_CIRCOS_CHR_DATA это мои данные о местоположении
- DC3_DC7_CORD_PLOT содержит генную мутацию у пациента
- exp.conf - это мой файл конфигурации
Это был мой предыдущий вопрос, но теперь я хотел бы видеть мутацию образца пациента, которую я пробовал, и я получаю вывод, но он выглядит действительно тупым выводом Circos
Итак, вот мои файлы
В моем файле, который я пытаюсь построить, есть ген, имеющий мутацию с точки зрения пациента, которая колеблется от 1 до 53 пациентов при макс.
У NPM1 самая высокая мутация с 53 пациентами на графике, поэтому я попытался установить порог между> 10 и <3, чтобы установить цветную метку, которая маркирует число, которое он содержит. </p>
- Как я могу добавить имена генов к сюжету?
- Есть ли способ показать, что гены только с одной мутацией связаны друг с другом, аналогично для двух, связанных вместе, и так далее, и так далее.
Я пытался с ссылками, но не мог заставить его работать.
Там может быть очень фундаментально, что я не могу заставить его работать, я думаю, что
Любые предложения или помощь будут высоко оценены.
Если есть какое-либо решение R, использующее данные, которые я предоставил, это также было бы очень полезно