Я сделал 3d-модель в Blender, она состоит из нескольких частей, у каждой детали есть своя ось с разным вращением, я экспортировал детали в Collada, можно ли импортировать их в meshlab с позицией этой конкретной локальной оси и вращение
Нет, я не верю, что это возможно. У Meshlab нет понятия локальных осей, есть только глобальная система координат.