ordiplot3d цвет по типу лечения / категории

Question

Я должен сделать 3D-ординацию (NMDS), так как с 3D было слишком много стресса.

Я могу сделать 3D-рукоположение с помощью oriplot3d, но не могу понять, как раскрасить точки по категориям в моих метаданных. Также я использую Phyloseq.

Кто-нибудь знает простое решение?

Спасибо, Энди

Answer 1

ordiplot3d находится в пакете vegan3d . Он имеет следующую документацию (см. ?ordiplot3d):

col: Colours of points. Can be a vector, and factors are
      interpreted as their internal numerical codes.

В качестве аргумента необходимо указать имя переменной (вектора), содержащей «метаданные».