пакет «inSilicoDb» недоступен (для версии R 3.5.1) - PullRequest
0 голосов
/ 05 ноября 2018

Я не могу установить inSilicoDb. Я получаю это сообщение:

источник ( "https://bioconductor.org/biocLite.R") Биокондуктор версии 3.8 (BiocInstaller 1.32.1),? BiocLite за помощь biocLite ( "inSilicoDb") BioC_mirror: https://bioconductor.org Используя Bioconductor 3.8 (BiocInstaller 1.32.1), R 3.5.1 (2018-07-02). Установка пакета (ов) «inSilicoDb» Старые пакеты: «решетка» Обновить все / некоторые / нет? [A / S / N]: s решетка: Версия 0.20-35 установлена ​​в /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library Версия 0.20-38 доступна на https://cran.rstudio.com Обновить? (Да / Нет / Отмена) Да

Доступна бинарная версия, но исходная версия позже: двоичный источник решетка 0,20-35 0,20-38 ИСТИНА

Вы хотите установить из исходников пакет, который требует компиляции? (Да / нет / отмена) установка исходного пакета "решетка"

пробуя URL 'https://cran.rstudio.com/src/contrib/lattice_0.20-38.tar.gz'

Тип содержимого «application / x-gzip», длина 359031 байт (350 КБ)

скачано 350 КБ

  • установка source пакета "решетка" ... ** пакет «решетка» успешно распакован и проверены суммы MD5 ** libs xcrun: ошибка: неверный путь активного разработчика (/ Library / Developer / CommandLineTools), отсутствует xcrun в: / Library / Developer / CommandLineTools / usr / bin / xcrun ОШИБКА: ошибка компиляции для пакета "решетка"
  • удаление ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/lattice’
  • восстановление предыдущей ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.5/Resources/library/lattice’

Загруженные исходные пакеты находятся в «/ Частный / вар / папки / пар / fpj_rv5x76zb7j28l89g2hb40000gn / T / RtmpQj1iBm / downloaded_packages» Предупреждающие сообщения: 1: «biocLite» устарел. Вместо этого используйте «BiocManager :: install». Смотрите справку («Устаревший») 2: пакет «inSilicoDb» недоступен (для версии R 3.5.1) 3: в install.packages (update [instlib == l, "Package"], l, repos = repos,: установка пакета «решетка» имела ненулевой статус выхода

BiocManager :: установить ( "inSilicoDb") Биокондуктор версии 3.8 (BiocManager 1.30.3), R 3.5.1 (2018-07-02) Установка пакета (ов) «inSilicoDb» Обновление старых пакетов: «решетка» Обновить все / некоторые / нет? [A / S / N]: N Предупреждающее сообщение: пакет «inSilicoDb» недоступен (для версии R 3.5.1)

...