Для Pepper вы должны использовать Choregraphe 2.5, который действительно предназначен для Pepper (хотя технически он также работает на NAO). Не существует NAOqi 2.8 для Pepper.
Ваша проблема заключается в том, что проект, созданный с помощью Choregraphe 2.8, будет иметь файл .pml с форматом версии 5, который более старые версии Choregraphe не поддерживают. Тем не менее, в большинстве случаев, кроме флага format_version, нет существенных различий между форматами (вероятно, они будут, если вы используете некоторые из новых функций Choregraphe 2.8), вы можете просто открыть свой файл .pml в текстовом редакторе, изменить
<Package name="your-package-id" format_version="5">
до
<Package name="your-package-id" format_version="4">
... и вы сможете открыть его с помощью Choregraphe 2.5 (если вы не использовали некоторые необычные функции).