Возможно ли иметь более одного динамического подстановочного знака в моем конвейере snakemake? - PullRequest
0 голосов
/ 14 ноября 2018

У меня есть рабочий конвейер snakemake с динамическим подстановочным знаком.Однако, когда я пытаюсь добавить новые правила, которые используют новый / другой динамический подстановочный знак, тогда все перестает работать.

Мой вопрос: Могу ли я иметь более одного динамического подстановочного знака в моем конвейере?

Вот мой общий рабочий процесс

  1. Метагеном бинсчитывает видовые кластеры
  2. Используя белковые фасты каждого бина / вида, создайте масштабную модель генома для каждого бина (для этого требуется один динамический подстановочный знак)
  3. Использование ДНК-фаста каждого бина / вида генерируютотчет об изобилии и классификации для каждого бина (для этого требуется другой шаблон)

Мой второй вопрос: Есть ли другой способ, кроме использования dynamic (), который удовлетворит мои требования?Или мне обязательно нужно использовать dynamic ()?

Я могу опубликовать свои правила / код, если это поможет ответить на мой вопрос.Заранее спасибо.

...