Лопата в FlowJo v10.0 - PullRequest
Новая
       10

Лопата в FlowJo v10.0

0 голосов
/ 23 сентября 2018

У меня проблема с установкой пакета лопаты в R: 

> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
Bioconductor version 3.7 (BiocInstaller 1.30.0), ?biocLite for help
> biocLite("spade")
BioC_mirror: https://bioconductor.org
Using Bioconductor 3.7 (BiocInstaller 1.30.0), R 3.5.1 (2018-07-02).
Installing package(s) ‘spade’
Old packages: 'foreign', 'survival'
Update all/some/none? [a/s/n]: 
n
Warning message:
package ‘spade’ is not available (for R version 3.5.1) 
>

введите описание изображения здесь

1 Ответ

0 голосов
/ 28 сентября 2018

Проблема, скорее всего, связана с тем, что в списке пакетов, удаленных в версии BioConductor 3.4, появляется спейд.См .: https://bioconductor.org/about/removed-packages/

Попытка установить последнюю версию spade_1.8.0 в R 3.5.1 не удалась, поскольку она зависит от другого заброшенного пакета igraph0.igraph0 заменено на igraph.* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * 1.пакеты, которые установочный скрипт определил как отсутствующие.Это не имело значения в этом случае (и в любом случае это было вводящее в заблуждение сообщение), но я бы не рекомендовал эту практику в будущем.

...