возвращение f-статистики из функции ancom - PullRequest
0 голосов
/ 29 ноября 2018

Я использую scikit-bio для запуска ANCOM на некоторых таблицах OTU, и я хотел бы иметь возможность создавать графики вулканов, чтобы помочь мне интерпретировать мои результаты, как обсуждалось здесь , но таблица вернула толькоимеет статистику W, а не f-статистику.Возможно ли это сделать?

Код, который я запускаю:

ancom_df, percentile_df = ancom(df, grouping, alpha = 0.05, multiple_comparisons_correction = 'holm-bonferroni', significance_test='scipy.stats.f_oneway')

Если это невозможно, лучше всего использовать плагин QIIME2 вместо этого?

...