Меня смущает вывод Канонического анализа соответствия из пакета skbio .
У меня 26 образцов с 35 переменными и 9 переменными среды.
Проверяя вывод (.OrdinationResults) после анализа, я получаю следующее:
- 52 компонентов CCA (
.samples) - 52 загрузки CCA (
.proportion_explained). Однако они кажутся отсортированными по 26 - biplot_scores для 9 переменных среды по 26 компонентам CCA (
.biplot_scores).
Мои вопросы:
- Как можно должно быть удвоение количества загрузок по сравнению с числом biplot_scores?
- Как следует интерпретировать отсортированные значения нагрузок? (поскольку компонент 1 и компонент 27 имеют самое высокое собственное значение)
Я также разместил выпуск в репозитории github, но пока без ответа.