Создание нулевых последовательностей с помощью gkmSVM для мышиного генома mm10

Question

Кто-нибудь когда-нибудь пытался создать нулевую модель последовательности ДНК у мыши, используя пакет gkmSVM ?Он отлично работает для человека, но для мыши - нет.Мне интересно, если кто-нибудь из вас никогда не использовал этот пакет для мышей и имел такую ​​же проблему.

При использовании функции genNullseqs возникает ошибка:

library(gkmSVM)
library(BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10)
library(BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked)
library(IRanges)

genome=BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm10.masked

fileBedBreaks="Rep1.intersec.Rep2.cov.major2.sort.uniq.bed"
fileFastaPos="Rep1.intersec.Rep2.cov.major2.all.sort.uniq.bed.pos.fa"
fileBedNeg="Rep1.intersec.Rep2.cov.major2.all.sort.uniq.Random.gkmSVM.bed"
fileFastaNeg="Rep1.intersec.Rep2.cov.major2.all.sort.uniq.Random.gkmSVM.fa"

genNullSeqs(inputBedFN=fileBedBreaks,nMaxTrials=5,xfold=2,genome=genome,
            outputPosFastaFN=fileFastaPos,outputBedFN=fileBedNeg,
            outputNegFastaFN=fileFastaNeg)

Ошибка

Error in normalizeDoubleBracketSubscript(i, x, exact = exact) :
      subscript "TRF" matches no name