R-пакет веганский декорана - PullRequest
Новая
       5

R-пакет веганский декорана

0 голосов
/ 07 февраля 2019

введите описание изображения здесь Я новичок в R, и я пытался запустить анализ соответствия Detrended (DCA), который представляет собой многомерный статистический анализ для определения вида, у меня есть четыре сайта.Я получаю сообщение об ошибке: 

> Error rowsums x must be numeric 

Species     Haasfontein Mini Pit    Vlaklaagte Mini Pit Vlaklaagte Block 3 Mini Pit Block 10 Mini Pit
Agrostis lachnantha 1   0   0   0
Aristida congesta subsp. Congesta   0   0   0   0
Brachiaria nigropedata  0   0   0   0
Cynodon dactylon    0   12  2   3
Cyperus esculentus  0   5   0   0
Digitaria eriantha  0   1   6   20
Elionurus muticus   0   0   0   0
Eragrostis acraea De Winter 0   0   1   0
Eragrostis chloromelas  35  0   12  4
Eragrostis curvula  6   0   0   0
Eragrostis lehmanniana  5   0   0   0
Eragrostis rigidior 3   0   1   0
Eragrostis rotifer  3   0   0   0
Eragrostis trichophora  10  1   2   2
Hyparrhenia hirta   0   0   9   1
Melinis repens  0   0   2   0
Panicum coloratum   0   4   0   0
Panicum deustum     3   0   0   0
Paspalum dilatatum  0   0   0   0
Setaria sphacelata var. sphacelata  0   1   0   0
Sporobolus africanus    0   0   2   0
Sporobolus centrifuges  1   0   1   0
Sporobolus fimbriatus   0   0   0   0
Sporobolus ioclados 2   0   5   1
Themeda triandra    0   0   0   0
Trachypogon spicatus    0   0   0   0
Tragus berteronianus    0   0   0   1
Verbena bonariensis 16  0   2   0
Cirsium vulgare 0   0   0   0
Eucalyptus cameldulensis    1   0   0   0
Xanthium strumarium 0   0   0   0
Argemone ochroleuca 0   0   0   0
Solanum sisymbriifolium 0   0   0   0
Campuloclinium macrocephalum    7   0   0   0
Paspalum dilatatum  0   0   0   0
Senecio ilicifolius 0   0   0   0
Pseudognaphalium luteoalbum (L.)    8   0   0   0
 Cyperus esculentus     0   0   0   0
Foeniculum vulgare  0   0   0   0
Conyza canadensis   0   0   0   1
Tagetes minuta  0   0   0   0
Hypochaeris radicata    0   0   0   0
Solanum incanum 0   0   0   0
Asclepias fruticosa 11  0   0   0
Hypochaeris radicata    0   0   0   0

Мои данные организованы, как показано выше, и я не уверен, что мои данные организованы правильно или есть какая-то другая ошибка.Может кто-нибудь, пожалуйста, помогите мне

1 Ответ

0 голосов
/ 08 февраля 2019

Вы все еще боретесь за получение данных в R .Это твоя первая проблема.После того, как вы решите эту проблему и сможете прочитать ваши данные, у вас возникнут следующие проблемы:

  1. В ваших данных не должно быть пустых (все ноль) строк, но они приведут к ошибке (пусто).столбцы удаляются и выдают только предупреждение).
  2. DCA обрабатывает строки и столбцы несимметрично, и вы должны иметь виды в качестве столбцов, а единицы выборки - в виде строк.Вы должны транспонировать свои данные (функция t()).
  3. Вы действительно не должны использовать DCA только с четырьмя единицами выборки.Это будет бессмысленно.

Я думаю, что последний пункт является наиболее важным.

...