Я не совсем понимаю, какова ваша взаимосвязь между сценами заигрыши и вашей основной / сюжетной сценой, но ..
В Настройках сборки в меню Файл вы можете изменить порядок своих сцен.Убедитесь, что сценарий запуска / обучения / любой сцены, с которой вы хотите начать, находится вверху списка.
update;пс.переключение, вероятно, проще, чем-то вроде:
if (health == 0)
{
switch(SceneManager.GetActiveScene()){
case SceneManager.GetSceneByName("Level 2 - Damages"):
SceneManager.LoadScene("Gameover 1");
break;
case default:
SceneManager.LoadScene("MainMenu");
}
}