Как выбрать субъединицу пимола по имени?

Question

Я работаю с 5IVW, загруженным с PDB.Это имеет 5 субъединиц;у каждого своя нумерация остатков - если я окрашиваю остатки 1-100, 5 комплектов остатков окрашиваются.Если я выбираю атомы мышью, я вижу идентификацию субъединицы: например, 5IVW / B / ...;то есть я выбрал атомы в субъединице B. Но как мне выбрать субъединицу или что-нибудь в pymol по ее внутреннему названию, чтобы я мог просто покрасить остатки в субъединице B?Документация содержит обширную информацию о выборе по атому, элементу, остатку и т. Д.

Answer 1

Посмотрите в разделе Макромолекулы на 5IVW .Здесь шесть цепочек (или субъединиц) в структуре названы V , W , 0 , 1 , 2. и 3 .поэтому ваш синтаксис для выбора под названием «subunit2» должен быть следующим:

select subunit2, chain W

обратите внимание, что в / 5ivw / B B обозначает segi-идентификатор, а не цепочку или субъединицу.