Я использую Biopython для выполнения различных операций над файлом pdb. Впоследствии я хотел бы...

Я генерирую 30 асимметричных единиц белковой структуры. Теперь я хочу выбрать различные комбинации...

Я пишу парсер для разбора файлов PyMOL (язык для биоинформатики). Я знаю, что символ двойной...

Я выделил (цветные) остатки, представляющие интерес на Pymol, в разных цепочках во многих файлах...

Мне не удалось раскрасить только остаток определенной цепи в Пимоле.Извините, это кажется ясным...

Я загрузил и использовал pymol на моем Mac.Я открываю его из папки приложений.Я могу успешно...

Итак, я пишу код для загрузки и выравнивания двух разных файлов pdb в pymol, а затем сохраняю части...

Я пытаюсь написать скрипт на python, который в конце откроет файлы в pymol. Однако у меня возникли...

Я использую плагин Pymool Autodock / Vina (в Ubuntu 18.04). Это зависит от AutoDockTools (чья...

Я использую плагин Autodock / Vina PyMOL (в Ubuntu 18.04) для слепой стыковки.Он выполняет стыковку...

Я только что установил библиотеку openbabel для Python 2.7 (на Ubuntu 18.04, на случай, если это...

Я использую блокнот Jupyter для запуска скрипта Pymol, который должен создать небольшое видео

Цель: я хочу сравнить вычисление RMSD для того же остатка, например, 131Thr, из файлов 2 pdb для...

У меня есть набор вращательных матриц 3x3 и набор соответствующих векторов трансляции для поз...

Я написал скрипт на python для рисования молекул в PyMol с использованием API PYMOL. Я загрузил...

Я немного боролся с тем, чтобы убедить (скажем, лиганд или кофакторы) выскочить из молекул, как вы...

Я работаю с 5IVW, загруженным с PDB.Это имеет 5 субъединиц;у каждого своя нумерация остатков - если...

Я использую это set_dihedral atom1_name, atom2_name, atom3_name, atom4_name, angle например...

Я пишу программу, в которой нужно будет использовать pymol, на данный момент я только добавил...