Плагин PyMOL Autodock не может просматривать позы - PullRequest
0 голосов
/ 03 июня 2019

Я использую плагин Autodock / Vina PyMOL (в Ubuntu 18.04) для слепой стыковки.Он выполняет стыковку довольно хорошо, но когда на вкладке «Просмотр поз» я пытаюсь загрузить файл pdbqt, он выдает такую ​​ошибку:

Error: 8
TypeError Exception in Tk callback
Function: <bound method Autodock.load.ligand_file of <pmg_tk.startup.autodock_plugin.Autodock object at 0x7f174942db00>> (type: <class 'method'>) 
Args: () 
Traceback (innermost last):
... 
   pose_list.sort(lambda a, b: cmp(a.energy, b.energy))
TypeError: sort() takes no positional arguments

Похоже на ошибку в сценарии (и предполагается, чтоработать нормально в соответствии с PyMOL Wiki), и я не могу решить эту проблему с помощью кодирования.Пожалуйста, помогите в ближайшее время.

...