Я работаю над углубленным изучением медицинских изображений и использую пакет nibabel для чтения файлов .nii в python.Мой код показан ниже.
import numpy as np
from pylab import *
import nibabel as nib
img_path=r"C:\\Users\\Umit Kilic\\Komodomyfiles\\umit\\myfile.nii"
nii_obj=nib.load(img_path)
img=nii_obj.get_fdata()
slice1=(img[60,:,:])
slice2=(img[:,80,:])
slice3=(img[:,:,60])
Затем я выбираю срез и хочу видеть на рисунке.
figure()
imshow(slice2)
show()
Вывод приведенного выше фрагмента кода выглядит следующим образом:
После этого я хочу применить некоторые операции, такие как:
slice2[:, :, 0] -= 123.68
slice2[:, :, 1] -= 116.779
slice2[:, :, 2] -= 103.939
Но я не могу.Причина, когда я запускаю этот код:
print(slice2.shape)
Вывод:
(121,121)
Обычно должен быть третий параметр, который сообщает количество каналов.Есть два параметра.Итак, мой slice2 оттенки серого или RGB?Как я могу применить операцию, которую я упомянул выше?