R-линейная модель с предикторами строк и столбцов - PullRequest
0 голосов
/ 16 октября 2018

Я новичок в создании моделей.У меня есть матрица (bpt2t) с генами в виде строк (~ 2000) и образцов (~ 400) в виде столбцов.Матрица является либо 0 (указывает на интактный ген), либо 1 (указывает на ген с делецией).

enter image description here

Я пытаюсь создать нуль-модель, используя glm.Предполагается, что более длинные гены имеют больше разрывов, чем маленькие, и что некоторые образцы имеют больше разрывов, чем другие.Я перебираю каждый элемент в этой матрице и называю его «перерыв».У меня есть другая переменная «длина гена», которая представляет собой длину на ген.способ также включить количество перерывов на образец?У меня есть переменная, которая представляет собой число разломов на образец, но она имеет другую длину, чем длина гена.

enter image description here

...