В пакете QuasR R Bioconductor сообщалось, что:
Ошибка в get (name, envir = asNamespace (pkg), наследует = FALSE): объект 'finalize_filexp' not found ", когдазапуск «example (qCount)».
Эта проблема появилась после того, как я обновил XVector и GenomicAlignments до последней версии. Как мне решить эту проблему?
Он работал хорошо, когда версия «XVector» была 0,20, а версия «GenomicAlignments» была 0,16
> example(qCount)
qCount> library(GenomicRanges)
qCount> library(Biostrings)
qCount> library(Rsamtools)
qCount> # copy example data to current working directory
qCount> file.copy(system.file(package="QuasR", "extdata"), ".", recursive=TRUE)
[1] TRUE
qCount> # load genome sequence
qCount> genomeFile <- "extdata/hg19sub.fa"
qCount> gseq <- readDNAStringSet(genomeFile)
Error in get(name, envir = asNamespace(pkg), inherits = FALSE) :
object 'finalize_filexp' not found