Я хочу провести некоторый анализ путей KEGG для некоторых RNAseq результатов с kegga(), но я не могу преобразовать мои данные в аргумент, который kegga() примет. Может кто-нибудь сказать мне, что мне нужно сделать? Я преобразовал свой dds объект в DGEList, но это тоже не работает.
test <- kegga(dge, species="Mm")
Error in kegga.default(dge, species = "Mm") :
components of de should be vectors
Любые идеи очень ценятся!