Можете ли вы более подробно рассказать о том, как вы рисуете спрайты?
Фильтрация текстур определяется объектами ID3D10SamplerState, привязанными к устройству. Если вы используете интерфейс ID3DX10Sprite, он не изменит шейдеры или сэмплеры для каждого набора спрайтов, а только текстуры. Поэтому будут использоваться любые шейдеры и сэмплеры, которые вы установили перед рисованием спрайтов - просто установите сэмплер с желаемым режимом фильтрации, прежде чем рисовать спрайты.